物理海洋学家，从事海洋潮汐、海洋环流和海洋数值建模研究，我国海洋潮汐学主要开拓者之一。其成果曾获得全国科学大会奖、中国科学院自然科学和科技进步奖及国家海洋局科技创新奖等多项奖励。

1939年12月25日，方国洪出生于浙江省温州瑞安市莘塍一个知识分子家庭，父亲方德植是厦门大学教授，担任过数学系主任，家中有一个比他大5岁的哥哥方国清。

1952年，进入浙江省瑞安中学就读初中部，之后就读高中部。

1956年，高中毕业考入南开大学物理系。

1958年，大三上学期时，中国科学院河北分院在天津成立海洋研究所，在学校要求下，中断学业“提前工作”（1961年7月学校补发了毕业证）。

1959年2月，到中国科学院河北分院参加国家科委组织的全国海洋普查工作，5月从天津到青岛，负责对测回来的潮流数据进行分析。

1964年7月，在中国科学院海洋研究所工作，先后担任研究实习员（1964年7月-1978年5月）、副研究员（1978年5月-1986年6月）、研究员（1986年6月-2003年2月）。

1980年1月，作为访问学者，前往美国德克萨斯A&M大学学习（至1982年1月）。

2003年2月，进入国家海洋局第一海洋研究所工作，担任研究员。

2007年，当选中国工程院院士，隶属于环境与轻纺工程学部（海洋环境科学工程与技术）。

2008年5月26日，被聘为中国科学院南海海洋研究所双聘院士。