创建的海洋耦合模式大幅提高了海洋预报能力，引起国内外巨大反响。担任2006年3月渤海溢油事件前线指挥部专家组组长，对溢油的漂游路径进行预报，迅速找到了漂浮的溢油位置，为国家及时掌握与处置这一事件赢得了宝贵时间

担任2006年3月渤海溢油事件前线指挥部专家组组长，对溢油的漂移路径进行预报，迅速找到了漂浮的溢油位置，为国家及时掌握与处置这一事件赢得了宝贵时间；为查找溢油源头提供重要科技支撑，最终确定出肇事船只。

在2008年6月抗击黄海浒苔灾害战役中，担任科学应对浒苔专家委员会副主任和前线指挥部副总指挥，组织相关科技人员一起全力投入浒苔的科技支撑工作中，查清了浒苔在青岛聚集的原因，提出的浒苔通道和奥帆赛场应急方案等系列措施，为确保奥帆赛的顺利进行发挥了重要作用。

乔方利是2015年中国工程院环境与轻纺工程学部院士增选的有效候选人[2]

2017年4月23日，在联合国教科文组织政府间海洋学委员会西太分委会第十一届政府间会议上，当选为西太分委会副主席。[1]

2017年05月，获得全国创新争先奖。